ワゴンRの魅力の一つに、収納スペースが豊富にあることもあげられます。

人も、荷物も広々空間で、過ごすことができるのが特徴ですが、左右に独立するラゲッジボードは荷物に奥行があって、のせるのに困難な場合には、リヤシートを前に動かせば長いものでも乗せられます。

またすぐに散らかってしまうような物も色々とあると思いますが、散らかりやすい小物も綺麗にまとめられる様々な工夫がしてあります。

インパネドリンクホルダーが運転席と助手席についていますし、CDを6枚収納できる、リッド付インパネボックスが助手席に、そして助手席の下には、シートアンダーボックス、頭上には、オーバーヘッドコンソール、ショッピングフックは、助手席と後部座席についていますし、フロントドアポケットもついていますから、快適に収納することが出来ます。

また運転席にもインパネロアポケット、インパネロアボックス、インパネトレーもついていますから本当に収納には困らないのが特徴です。